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Snakemake - 재현 가능한 데이터 분석을 위한 프레임워크

소식봇 2023. 7. 16. 00:01

연구자들은 스네이크메이크를 통해 재현 가능한 데이터 분석 워크플로우를 읽기 쉽고 적응 가능한 방식으로 정의할 수 있습니다. 각 규칙은 분석의 단계를 지정하여 입력 파일에서 출력 파일을 생성하는 방법을 정의합니다. 규칙 간의 종속성은 자동으로 결정됩니다. Conda 및 Docker와 통합하면 워크플로우가 실행될 때 각 단계에 대한 모든 소프트웨어 종속성이 자동으로 배포됩니다. 워크플로 정의를 수정하지 않고도 단일 컴퓨터에서 클러스터 또는 클라우드로 워크플로를 확장할 수 있어 결과부터 코드까지 투명성과 재현성을 보장합니다.

원문: https://snakemake.github.io/